تتمثل أهم أسباب حرقة المعدة في استعداد المعدة أصلاً للتعرض للحرقة؛ وذلك يحدث في الغالب بسبب زيادة نسبة حامض المعدة، والتي قد تتسبب بوصولها إلى المريء إلى الإصابة بحرقة معدة مزمنة، والتعرض أيضاً إلى الإرتجاع المريئي.
هناك أيضاً الميل الشديد للقيء والغثيان في الصباح، وكذا المجاومة على بعض السلوكيات الخاطئة في عادات الاسترخاء أو العمل، وكذلك في تناول الغذاء.