يعتمد العلاج المتبع لمواجهة الصداع الجنسي على السبب الرئيسي وراءه، ففي الحالات المذكورة سابقاً، قد لا يحتاج المريض أكثر من مسكنات ألم عادية.
ولكن وفي الحالات الحادة التي يترافق فيها الصداع الجنسي مع أعراض أخرى، مثل تصلب العنق أو التقيؤ، هذا قد يعني أن الحالة أكثر من مجرد صداع جنسي، وأن المريض قد يكون مصاباً بإحدى المشاكل الصحة التالية:
- نزيف في الدماغ.
- مضاعفات محتملة لدواء جديد.
- الإصابة بورم.
- الإصابة بجلطة أو سكتة.
- الإصابة بمرض أم الدم.
- الإصابة بمرض الشرايين التاجية.
- وجود مشاكل في الحبل الشوكي.
وبعد تشخيص المشكلة، يقوم الطبيب بوصف العلاج المناسب للحالة وعمل الإجراءات الطبية اللازمة.