هناك عدة طرق للكشف عن وتشخيص جرثومة المعدة، نذكر بعضها فيما يأتي:
1. فحص الدم
يتم استخدام هذا الفحص لتحديد إيجابية أو سلبية وجود جرثومة المعدة، لكن لتشخيص أدق يتجنب الطبيب عادةً هذا الفحص حيث أن تشخيص البراز يعد أدق.
2. فحص النفس
تقوم عادةً جرثومة المعدة بكسر مادة اليوريا وتحويلها إلى ثاني أكسيد الكربون، يقوم الطبيب في هذا الفحص بإعطاء المريض سائل يحوي مادة اليوريا.
يتم الزفير في كيس، يتم إرساله إلى المختبر لتحليل كمية ثاني أكسيد الكربون التي تم إخراجها، في حال قام المريض عند الزفير بإخراج كمية أكبر من ثاني أكسيد الكربون، يعني ذلك وجود جرثومة المعدة.
3. التنظير
تعد طريقة التنظير غير مريحة للمريض حيث يقوم الطبيب بإدخال منظار مزود بكاميرا للكشف عن وجود جرثومة المعدة.
نتيجة لعدم الراحة التي قد يتعرض لها المريض من ذلك المنظار يتجنب الطبيب استخدام هذه الطريقة إلا إذا اضطره الأمر، مثل أن يشك بوجود قرحة معدة أو مشاكل أخرى.