هناك بعض المخاطر والمضاعفات التي من الممكن أن ترتبط بإجراء عملية الخصية المهاجرة في بعض الأحيان، ومن أهم هذه المضاعفات التي من الممكن أن يعاني منها بعض المصابين ما يأتي: