يعد الاستهلاك المعتدل للكمثرى امن على الصحة ولن يشكل أي اثار جانبية، لكن الإفراط في تناولها له أضرار قد لا يعرفها الجميع، ومنها:
- مشكلات في الجهاز الهضمي، وذلك لأن الكمثرى تحتوي في الأساس على نسبة عالية من الألياف، ونسبة الألياف المرتفعة قد تتعارض مع امتصاص الفيتامينات في الجسم.
- الصداع، وانتفاخ المعدة، والإسهال، وحرقة المعدة، والغثيان، وجميع هذه الأضرار تحدث عند ارتفاع نسبة فيتامين ج بشكل مفرط.
- الإصابة بأنواع مختلفة من السرطان، وذلك بسبب الارتفاع المفرط للمواد المضادة للأكسدة، إذ تبين أن ارتفاع نسبة فيتامين هـ قد يؤدي إلى زيادة خطر الإصابة بسرطان البروستاتا.
- الدوخة، وضعف الشهية، وضبابية الرؤية، والام العظام، وتورم العظام وغيرها من الاثار الجانبية التي قد تحدث نتيجة ارتفاع مستويات فيتامين أ.