قد يتعرض بعض الأشخاص إلى اثار جانبية بعد البدء بأخذ حبوب البكتيريا النافعة، ولكنها تتوقف بعد عدة أيام من الاستخدام، كما ينصح بأخذ الحبوب بعد الأكل على معدة ممتلئة. ومن أبرز الاثار الجانبية ما يليل:
في هذه الحالة أوقف إستخدام المنتج فورًا وتواصل مع طبيبك.